RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 NOVP48745 357 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CDR1P51861 262 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PPP4CP60510 307 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PTK2Q05397 1052 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 METTL13Q8N6R0 699 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 RAPGEF5Q92565 580 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SGSM3Q96HU1 749 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 FLT3P36888 993 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ARID5AQ03989 594 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SNCBQ16143 134 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 DONSONQ9NYP3 566 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NARFQ9UHQ1 456 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NAGPAQ9UK23 515 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 GHRP10912 638 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PRKCIP41743 596 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 XRCC4Q13426 336 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 FAM228AQ86W67 206 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TLCD1Q96CP7 247 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 F8VZ95 297 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SCTRP47872 440 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 ADCY7P51828 1080 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KCNH2Q12809 1159 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CENPTQ96BT3 561 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 EYA3Q99504 573 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 JAG2Q9Y219 1238 aa14.83□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KRIT1O00522 736 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 DAPK3O43293 454 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 BAG3O95817 575 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GYS1P13807 737 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 DRD4P21917 467 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CDK8P49336 464 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CCT6BQ92526 530 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 HAS1Q92839 578 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PSMD1Q99460 953 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.83□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NPEPPSP55786 919 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 GSTO1P78417 241 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ODF2Q5BJF6 829 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 SWAP70Q9UH65 585 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 AMACRQ9UHK6 382 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 INTUQ9ULD6 942 aa14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LRRC17-201ENST00000249377 PPFIA2O75334 1257 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms