RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 EPHB6O15197 1021 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 FAM13AO94988 1023 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 GCNT3O95395 438 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 NR3C2P08235 984 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ELF2Q15723 593 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ATP2A1O14983 1001 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CCNE2O96020 404 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 UGCGQ16739 394 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 MYCT1Q8N699 235 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 OTUD5Q96G74 571 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ACAD9Q9H845 621 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.56■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM150BA6NC51 233 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 IRF6O14896 467 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 KIF20AO95235 890 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 MUTP22033 750 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ADAM9Q13443 819 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CEP63Q96MT8 703 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 DNAJC7Q99615 494 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 LCTP09848 1927 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC175P0C221 793 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 NR2F2P24468 414 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 WDR59Q6PJI9 974 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 KSR1Q8IVT5 923 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CDCA5Q96FF9 252 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 DNAI1Q9UI46 699 aa20.55■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 RGS20O76081 388 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CCND2P30279 289 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 NEK9Q8TD19 979 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 PARVGQ9HBI0 331 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ASTN1O14525 1302 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.54■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 GAP43P17677 238 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 FIZ1Q96SL8 496 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 MYH11P35749 1972 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 EPHX2P34913 555 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 PADI6Q6TGC4 694 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 DAW1Q8N136 415 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 BTBD7Q9P203 1132 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 MYPNQ86TC9 1320 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.53■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 HIP1RO75146 1068 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF131P52739 623 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 MAPK7Q13164 816 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 NUP58Q9BVL2 599 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 SORBS3O60504 671 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 RETREG2Q8NC44 543 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 WDR24Q96S15 920 aa20.52■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 PDXKO00764 312 aa20.51■□□□□ 0.87
SIKE1-201ENST00000060969 CETN3O15182 167 aa20.51■□□□□ 0.87
SIKE1-201ENST00000060969 CLIC2O15247 247 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms