RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NptxrQ99J85 493 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rtfdc1Q99K95 307 aa25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef19Q8BWA8 802 aa25.48■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5591Q8CDK1 855 aa25.48■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FcrlaQ920A9 352 aa25.48■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc96Q9CR92 584 aa25.48■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccng2O08918 344 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 St18Q80TY4 1045 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smad3Q8BUN5 425 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Agbl3Q8CDP0 1006 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf445Q8R2V3 986 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ifih1Q8R5F7 1025 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rem2Q8VEL9 341 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cnpy2Q9QXT0 182 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hs6st3Q9QYK4 470 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Extl3Q9WVL6 918 aa25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clk2O35491 499 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcat1P24288 386 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Crtc1Q68ED7 630 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plppr4Q7TME0 766 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Amer1Q7TS75 1132 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prkag3Q8BGM7 489 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q9CYI0 393 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lmbr1Q9JIT0 490 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sucla2Q9Z2I9 463 aa25.46■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa25.45■■□□□ 1.67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P04214 136 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rfx1P48377 963 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmod1P49813 359 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clcn3P51791 818 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Raver2Q7TPD6 673 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr832Q7TRG9 312 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sept8Q8CHH9 429 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgrg3Q8R0T6 542 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CutaQ9CQ89 177 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cabp5Q9JLK3 173 aa25.45■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Akap17bA2A3V1 959 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfr2E9Q5M4 874 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ampd3O08739 766 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccl5P30882 91 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Yap1P46938 488 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tarbp2P97473 365 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Epha2Q03145 977 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clstn3Q99JH7 956 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Polr3eQ9CZT4 710 aa25.44■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm6133B2RY53 190 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sptbn5F6UCX4 1208 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdh15P33146 784 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rsph3aQ3UFY4 516 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc2a13Q3UHK1 637 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssh1Q76I79 1042 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hook2Q7TMK6 716 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Celf4Q7TSY6 486 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Liat1Q810M6 228 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppme1Q8BVQ5 386 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 VasnQ9CZT5 673 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mageb3Q9D2H4 330 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rsph3bQ9DA80 389 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acox2Q9QXD1 681 aa25.43■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klhl34A2AI76 644 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptchd4B9EKX1 904 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm8909G3UXE9 396 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3164L7N2B9 238 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3264L7N2C5 238 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnaseh1O70338 285 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr25P0C5I1 358 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kmt5aQ2YDW7 349 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Echdc2Q3TLP5 296 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spdye4aQ5IBH6 268 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P4ha1Q60715 534 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Drc7Q6V3W6 876 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp38Q8BW70 1042 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp113Q8C689 439 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mettl24Q8CCB5 363 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr11Q8K1X1 1223 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GhdcQ99J23 532 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NenfQ9CQ45 171 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nap1l5Q9JJF0 156 aa25.42■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd70O55237 195 aa25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Axin2O88566 840 aa25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Islr2Q5RKR3 745 aa25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tas2r124Q7M718 309 aa25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc9bQ9D6E4 239 aa25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wfdc1Q9ESH5 211 aa25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Akt3Q9WUA6 479 aa25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scp2P32020 547 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.1 ms