RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	YKL187C	P34231	750 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	DTR1	P38125	572 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ATG7	P38862	630 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	FET3	P38993	636 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SEN34	P39707	275 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	REE1	P40893	198 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	FMP32	P43557	207 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MAD3	P47074	515 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YGR066C	P53242	292 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YNR068C	P53754	272 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SLT2	Q00772	484 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	TAF11	Q04226	346 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SMA2	Q04658	369 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	DCR2	Q05924	578 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	TDA6	Q06466	467 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GEP5	Q12393	293 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	HEM4	P06174	275 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PET111	P08468	800 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RAD51	P25454	400 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YEF1	P32622	495 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SOH1	P38633	127 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	REV7	P38927	245 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MSS4	P38994	779 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	AIM2	P39721	246 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PEP8	P40335	379 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YIL067C	P40514	678 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MEP2	P41948	499 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RHO4	Q00246	291 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YPL109C	Q02981	657 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	VTI1	Q04338	217 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GPB1	Q08886	897 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	APC9	Q12107	265 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	NTO1	Q12311	748 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ALG7	P07286	448 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	COS2	P0CX12	379 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	COS3	P0CX13	379 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GAL3	P13045	520 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RPB5	P20434	215 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ROX1	P25042	368 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SSO1	P32867	290 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SPO23	P33757	523 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RPC37	P36121	282 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PHO89	P38361	574 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YHL037C	P38733	133 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SKN7	P38889	622 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YTA6	P40328	754 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ALG5	P40350	334 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	NDC80	P40460	691 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	COS4	P43542	379 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YFL051C	P43552	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YJR154W	P47181	346 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ZIP2	P53061	704 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	BIO4	P53630	237 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	UBX4	P54730	416 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YML131W	Q03102	365 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	TFB3	Q03290	321 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PNP1	Q05788	311 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	FDH1	Q08911	376 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GET4	Q12125	312 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SLP1	Q12232	587 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YVC1	Q12324	675 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	CCW14	O13547	238 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	FLP1	P03870	423 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PRB1	P09232	635 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	BAR1	P12630	587 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	NMT1	P14743	455 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	CBS2	P14905	389 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	AAC3	P18238	307 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	FPS1	P23900	669 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	NFS1	P25374	497 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MRPS5	P33759	307 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SET3	P36124	751 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	COS111	P38308	924 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MGE1	P38523	228 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YER010C	P40011	234 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	JEM1	P40358	645 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MET18	P40469	1032 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YIL012W	P40551	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.98	□□□□□ -1.77	not detected
YNL057W	YNL057W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.6 ms