RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	SPO11	P23179	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PPH22	P23595	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MCH2	P36032	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FIG4	P42837	879 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SNG1	P46950	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SBH2	P52871	88 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	COS12	P53053	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FMP48	P53233	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HXT17	P53631	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SDH1	Q00711	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	EEB1	Q02891	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PFA5	Q03289	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MFB1	Q04922	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	AFI1	Q99222	893 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SAS5	Q99314	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	COB	P00163	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SLC1	P33333	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YEL068C	P39977	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GDS1	P41913	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PMT4	P46971	762 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YJL043W	P47053	257 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GPI1	P53306	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	BUD17	P53727	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TEP1	P53916	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	COG5	P53951	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	REG1	Q00816	1014 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	VCX1	Q99385	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ARG82	P07250	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CBS2	P14905	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
SFI1	YLL003W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TVP38	P36164	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PPS1	P38148	807 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	AFG3	P39925	761 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	NTA1	P40354	457 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RMD8	P43620	662 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	UBC12	P52491	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TIM21	P53220	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YGR066C	P53242	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PEX30	Q06169	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ATX2	Q12067	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TPK1	P06244	397 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	SNF3	P10870	884 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	FPS1	P23900	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	AHC2	P25649	128 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	SIP1	P32578	815 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	DTR1	P38125	572 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	SFB3	P38810	929 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	FAD1	P38913	306 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	GPB2	P39717	880 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	PHM8	P40025	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	JHD1	P40034	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	ALY2	P47029	1046 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	AZR1	P50080	613 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	NBP35	P52920	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	GIS1	Q03833	894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	MDM30	Q05930	598 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	NUT2	Q06213	157 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	HDA2	Q06629	674 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	SPO75	Q07798	868 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	THI21	Q08975	551 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	GPM2	Q12008	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SFI1	YLL003W	RTN2	Q12443	393 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms