RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YMR087W	Q04299	284 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FDH1	Q08911	376 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MSW1	P04803	379 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	APN1	P22936	367 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ADH7	P25377	361 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PAH1	P32567	862 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BCK2	P33306	851 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HXT7	P39004	570 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	VHR1	P40522	640 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HMS2	P47175	358 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NUP100	Q02629	959 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RPN4	Q03465	531 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BNA7	Q04066	261 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CDA2	Q06703	312 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YLR040C	Q07988	224 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ERD1	P16151	362 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ZRC1	P20107	442 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	OCA4	P25366	362 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PMT2	P31382	759 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SIP1	P32578	815 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ECM13	P38195	257 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	LAG1	P38703	411 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	AIM2	P39721	246 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YGR210C	P42942	411 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MNT2	P53059	558 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RSM27	P53305	110 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NRK1	P53915	240 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YKR011C	Q02209	353 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	KAP120	Q02932	1032 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GIP3	Q03016	1276 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YOL159C	Q08300	171 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TRM13	Q12383	476 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CSR2	Q12734	1121 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	APC1	P53886	1748 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SPS2	P08459	502 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	POX1	P13711	748 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.64	□□□□□ -1.99	not detected
ECM29	YHL030W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PHO3	P24031	467 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GPX2	P38143	162 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	UBA4	P38820	440 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	BOL3	P39724	118 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NTA1	P40354	457 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	GLC8	P41818	229 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	LSB6	P42951	607 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HOC1	P47124	396 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	DIA3	P52290	468 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	NUT2	Q06213	157 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	FRE3	Q08905	711 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YOR214C	Q12282	236 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PNS1	Q12412	539 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	APC2	Q12440	853 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SAC7	P17121	654 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	EPT1	P22140	391 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PBN1	P25580	416 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	COQ8	P27697	501 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YKL075C	P36083	450 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HMT1	P38074	348 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YHR122W	P38829	231 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	VPS52	P39904	641 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MXR1	P40029	184 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	SAD1	P43589	448 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	AAD10	P47182	288 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	MRH4	P53166	561 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ACF2	Q12168	779 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	LCB4	Q12246	624 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	ICT1	Q12385	394 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	COX5A	P00424	153 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.63	□□□□□ -1.99	not detected
ECM29	YHL030W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RCN1	P36054	211 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	RRF1	P38771	230 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	HXT16	P47185	567 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	TGL2	P54857	326 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ECM29	YHL030W	CWC27	Q02770	301 aa		2.63	□□□□□ -1.99

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