RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604859.1

NEK4P3-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene NEK4P3, Length 544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P3-201ENST00000604859 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.74□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CCDC69A6NI79 296 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 DCXO43602 365 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PRC1O43663 620 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 DGKIO75912 1065 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MCM5P33992 734 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ZP2Q05996 745 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 UIMC1Q96RL1 719 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 JADE2Q9NQC1 790 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.73□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CALM1P0DP23 149 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CALM2P0DP24 149 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CALM3P0DP25 149 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 IGBP1P78318 339 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 HYAL1Q12794 435 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 UBE2SQ16763 222 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 IER5Q5VY09 327 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 TMEM87BQ96K49 555 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PLVAPQ9BX97 442 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 SQORQ9Y6N5 450 aa14.72□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 INSRRP14616 1297 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RXRAP19793 462 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CD52P31358 61 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 LIFRP42702 1097 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 IGFLR1Q9H665 355 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 AZI2Q9H6S1 392 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.71□□□□□ -0.05
NEK4P3-201ENST00000604859 MMP1P03956 469 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 CLUL1Q15846 466 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 FANCBQ8NB91 859 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 P2RX5Q93086 422 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 PCYT2Q99447 389 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 M0QZ92 97 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 MBTPS2O43462 519 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 IRS1P35568 1242 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 ADAM15Q13444 863 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 CAMK1Q14012 370 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 PADI3Q9ULW8 664 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 TRPC6Q9Y210 931 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 SLC27A2O14975 620 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 CSPG5O95196 566 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 STAG3L1P0CL83 205 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 STAT5BP51692 787 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 PLCB4Q15147 1175 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK4P3-201ENST00000604859 NME8Q8N427 588 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms