RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596548.1

C3-208, Transcript of complement C3, human

TSL 3

Gene C3, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C3-208	ENST00000596548	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	UBR7	Q8N806	425 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	B4GALT3	O60512	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	RFPL1	O75677	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SELENOP	P49908	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	TGFB2	P61812	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	MUSK	O15146	869 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	NPHP1	O15259	732 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ADCY3	O60266	1144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	TRIM27	P14373	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	FHL2	Q14192	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	MLC1	Q15049	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PLD2	O14939	933 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	GPR42	O15529	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	F2	P00734	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ACR	P10323	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ITGA4	P13612	1032 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	CD247	P20963	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	TGM1	P22735	817 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	HTR3A	P46098	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	MTMR1	Q13613	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
C3-208	ENST00000596548	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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