RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 NOD1Q9Y239 953 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM50BQ9Y247 325 aa26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1-214ENST00000592483 KPNA6O60684 536 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZP2Q05996 745 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC30A10Q6XR72 485 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 DNERQ8NFT8 737 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PHOX2BQ99453 314 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 C19orf67A6NJJ6 358 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 BTBD18B2RXH4 712 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2SQ16763 222 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 BRAPQ7Z569 592 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC155Q8N6L0 562 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CAGE1Q8TC20 777 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 AFAP1L1Q8TED9 768 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D5Q92609 795 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF25Q93038 417 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SIP14410 1827 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIOO75962 3097 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 B4DLN1 442 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 GPNMBQ14956 572 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MCTP1Q6DN14 999 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 BRD1O95696 1058 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 OXER1Q8TDS5 423 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ANO3Q9BYT9 981 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 NR5A1Q13285 461 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ADHFE1Q8IWW8 467 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 A6NJR5 290 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCAB14O75071 495 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CXCL10P02778 98 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SELPP16109 830 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SREBF1P36956 1147 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXK2Q01167 660 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PTGISQ16647 500 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPROQ16827 1216 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 IWS1Q96ST2 819 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 RMDN3Q96TC7 470 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM260Q9NX78 707 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 COL20A1Q9P218 1284 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP54Q96N23 3096 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAPPC10P48553 1259 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PXMP2Q9NR77 195 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 F13A1P00488 732 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN5P54829 565 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RESTQ13127 1097 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TIGD5Q53EQ6 642 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF16Q5VV41 709 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TAAR1Q96RJ0 339 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 INSL6Q9Y581 213 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNA1AO00555 2505 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LCTP09848 1927 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS3O15072 1205 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 IRS1P35568 1242 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 USP11P51784 963 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 COL19A1Q14993 1142 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS33Q8NF86 280 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CTAGE1Q96RT6 745 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NBNO60934 754 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 STAM2O75886 525 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP3A4P08684 503 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RBL2Q08999 1139 aa26.73■■□□□ 1.87
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