RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589742.5

RFX2-215, Transcript of regulatory factor X2, human

TSL 4

Gene RFX2, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX2-215	ENST00000589742	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	STX6	O43752	255 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	ATP4A	P20648	1035 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	IGBP1	P78318	339 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TREH	O43280	583 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	INSRR	P14616	1297 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	RAG1	P15918	1043 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	SFN	P31947	248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	JAK3	P52333	1124 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	REST	Q13127	1097 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	UGCG	Q16739	394 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	BAD	Q92934	168 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	ZNF862	O60290	1169 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	CYP2C18	P33260	490 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TEC	P42680	631 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	CCL23	P55773	120 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PTGDR	Q13258	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	GRIK4	Q16099	956 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	WNT8B	Q93098	351 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TIMP1	P01033	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	GNAT1	P11488	350 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	HOXC8	P31273	242 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	ADAM17	P78536	824 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	BECN1	Q14457	450 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	EPHA7	Q15375	998 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	SCLY	Q96I15	445 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	POTEM	A6NI47	508 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	HBP1	O60381	514 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	SLC26A2	P50443	739 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PRKCE	Q02156	737 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	PKP1	Q13835	747 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RFX2-215	ENST00000589742	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26

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