RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557403.5

RBM23-229, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-229	ENST00000557403	PTPRS	Q13332	1948 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ESYT2	A0FGR8	921 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	TK2	O00142	265 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ADAMTS3	O15072	1205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	HR	O43593	1189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ACTN1	P12814	892 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SELP	P16109	830 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	IFNAR1	P17181	557 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ZNF76	P36508	570 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SREBF1	P36956	1147 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	EVC	P57679	992 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	C6orf50	Q9HD87	102 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	CPLX1	O14810	134 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MAFG	O15525	162 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	TREH	O43280	583 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	AR	P10275	920 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MARK3	P27448	753 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	GNA11	P29992	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	THPO	P40225	353 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	RABGGTB	P53611	331 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	RBL2	Q08999	1139 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	RAB30	Q15771	203 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	CEP55	Q53EZ4	464 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SERINC5	Q86VE9	423 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MYLIP	Q8WY64	445 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	GLG1	Q92896	1179 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SDF4	Q9BRK5	362 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ZNF576	Q9H609	170 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MSRA	Q9UJ68	235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	NBN	O60934	754 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	CTSH	P09668	335 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	GNAT1	P11488	350 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	HOXC8	P31273	242 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	GRIN2C	Q14957	1233 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	BICD2	Q8TD16	824 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	UIMC1	Q96RL1	719 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	EYS	Q5T1H1	3165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SI	P14410	1827 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	NFASC	O94856	1347 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	EMSY	Q7Z589	1322 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MEIS1	O00470	390 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	BAIAP3	O94812	1187 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	DEXI	O95424	95 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MYOG	P15173	224 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	FOSL2	P15408	326 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	KCNJ6	P48051	423 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	NLRP5	P59047	1200 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ANAPC15	P60006	121 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ACTR2	P61160	394 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	GPNMB	Q14956	572 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SLC9A7	Q96T83	725 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM23-229	ENST00000557403	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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