RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DISC1Q9NRI5 854 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SAMM50Q9Y512 469 aa14.54□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BACH1O14867 736 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA0355O15063 1070 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHMP2AO43633 222 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HOXC8P31273 242 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STAT5BP51692 787 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTMR9Q96QG7 549 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF302Q9NR11 478 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBX21Q9UL17 535 aa14.53□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARID2Q68CP9 1835 aa14.52□□□□□ -0.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H0YGN5 161 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STX6O43752 255 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF174Q15697 407 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTGISQ16647 500 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTMR6Q9Y217 621 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOD1Q9Y239 953 aa14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NRCAMQ92823 1304 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LAD1O00515 517 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR52Z1P0C646 297 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GNAT1P11488 350 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MARK3P27448 753 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NBR1Q14596 966 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLCB4Q15147 1175 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FERMT3Q86UX7 667 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRPC6Q9Y210 931 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EVPLQ92817 2033 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POTEB3A0JP26 581 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYN1P17600 705 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TXKP42681 527 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RESTQ13127 1097 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPFIA1Q13136 1202 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POTEBQ6S5H4 581 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM167AQ96KS9 214 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COL1A2P08123 1366 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EML1O00423 815 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PITPNM1O00562 1244 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TIMP1P01033 207 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAG1P15918 1043 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADAM17P78536 824 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTGDRQ13258 359 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTK7Q13308 1070 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIC1Q14526 733 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GRIK4Q16099 956 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SERINC5Q86VE9 423 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CAGE1Q8TC20 777 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIPK3Q9H422 1215 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SETD4Q9NVD3 440 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCN5AQ14524 2016 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIP14410 1827 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HBP1O60381 514 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms