RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.17□□□□□ -0.94
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PTPRB-208ENST00000550358 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRB-208ENST00000550358 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
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