RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533744.6

SLC38A6-215, Transcript of solute carrier family 38 member 6, human

TSL 5

Gene SLC38A6, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A6-215	ENST00000533744	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ACOT7	O00154	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	IL18BP	O95998	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ACVRL1	P37023	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	RAC3	P60763	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CDC6	Q99741	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ST5	P78524	1137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PAK1	Q13153	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	KLF4	O43474	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CDC14B	O60729	498 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	POLD1	P28340	1107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ADCY8	P40145	1251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	EPHA5	P54756	1037 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	KLF10	Q13118	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	KCNK3	O14649	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PDE6A	P16499	860 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	COMT	P21964	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	KCNQ1	P51787	676 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	RAB33A	Q14088	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	EXTL1	Q92935	676 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	OVOL3	O00110	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	AQP7	O14520	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CUTA	O60888	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	HMGCR	P04035	888 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PYGM	P11217	842 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CR2	P20023	1033 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	DNM2	P50570	870 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	FOXE3	Q13461	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	GPR19	Q15760	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CRY1	Q16526	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-215	ENST00000533744	APP	P05067	770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-215	ENST00000533744	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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