RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GVG6 124 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 GMNCA6NCL1 334 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 USP17L10C9JJH3 530 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 MARCH6O60337 910 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 DIAPH2O60879 1101 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CDKL5O76039 1030 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 TTLL1O95922 423 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CYP27A1Q02318 531 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 KIF22Q14807 665 aa11.07□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 ERO1BQ86YB8 467 aa11.07□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 CAVIN3Q969G5 261 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.07□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 HOMER3Q9NSC5 361 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB43O43298 467 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CALM1P0DP23 149 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CALM2P0DP24 149 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CALM3P0DP25 149 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.07□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 AGAP11Q8TF27 550 aa11.07□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 CCT6BQ92526 530 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 FAM210AQ96ND0 272 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 PANK4Q9NVE7 773 aa11.07□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 TTC36A6NLP5 189 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 GLI1P08151 1106 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ABL2P42684 1182 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 NT5C2P49902 561 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 SNAPC2Q13487 334 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF6Q15052 776 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 TRIM73Q86UV7 250 aa11.06□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 CHURC1Q8WUH1 139 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.06□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 PNMA3Q9UL41 463 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 SPEF2Q9C093 1822 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 EMC10Q5UCC4 262 aa11.06□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.06□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 STAMQ92783 540 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 GINM1Q9NU53 330 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.06□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087X0B3 334 aa11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 ZBED4O75132 1171 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 FLOT1O75955 427 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 SREBF2Q12772 1141 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 RGMBQ6NW40 437 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA20Q8TB22 786 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 SNX12Q9UMY4 172 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.05□□□□□ -0.64
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 PIDD1Q9HB75 910 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 AKR1B1P15121 316 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 PRPHP41219 470 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 TNKSO95271 1327 aa11.05□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 FESP07332 822 aa11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CETPP11597 493 aa11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 ANTXR2P58335 489 aa11.04□□□□□ -0.64
TRPS1-211ENST00000520276 CCL15Q16663 113 aa11.04□□□□□ -0.64
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