RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	WNT9A	O14904	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	FBXO21	O94952	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	RASGRP1	O95267	797 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760		Q6ZUG5	572 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF20	P17024	532 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	MC4R	P32245	332 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CSF2RB	P32927	897 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	EPHB4	P54760	987 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	GABRE	P78334	506 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CPZ	Q66K79	652 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SCLY	Q96I15	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760		H0Y858	1186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ST5	P78524	1137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CDSN	Q15517	529 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CRY1	Q16526	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	KCNA6	P17658	529 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SURF1	Q15526	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SCD	O00767	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	MATN3	O15232	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	MPIG6B	O95866	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CHGB	P05060	677 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ADCY8	P40145	1251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	RRAD	P55042	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	IL13RA1	P78552	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	FOXS1	O43638	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	MME	P08473	750 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	PTGS1	P23219	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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