RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 CR2P20023 1033 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLD1P28340 1107 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCM7P33993 719 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF503Q96F45 646 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALG1Q9BT22 464 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD244Q9BZW8 370 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR2E1Q9Y466 385 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 CUTAO60888 179 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAD17O75943 681 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPNS1P04632 268 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR85P60893 370 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 DGCR2P98153 550 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF151Q2KHN1 245 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLNQ7Z5Q5 900 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 EDAQ92838 391 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM89AQ96GI7 184 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 BLACEA4D250 179 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACOT7O00154 380 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 NSMFQ6X4W1 530 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHFRQ96EP1 664 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 IPPKQ9H8X2 491 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 HMGCRP04035 888 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADCY8P40145 1251 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPHA5P54756 1037 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 SGSM3Q96HU1 749 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCYL1Q96KG9 808 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1SP09871 688 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGFR1P11362 822 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 ETV4P43268 484 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNQ1P51787 676 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 INHBEP58166 350 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARID5AQ03989 594 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 NTRK3Q16288 839 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 STYK1Q6J9G0 422 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPH6Q7L8W6 267 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR48Q8TAF3 677 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP89Q96ST8 783 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNCXA6NJT0 531 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP6O43182 974 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 HHEXQ03014 270 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDR2Q16832 855 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6ZSN1 163 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSBP2Q969R2 916 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLSCR1O15162 318 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms