RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 SLC7A5Q01650 507 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 CRY2Q49AN0 593 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 PAOXQ6QHF9 649 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 CD163Q86VB7 1156 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 CNTROBQ8N137 903 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 CLEC3AO75596 197 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 SRGNP10124 158 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 CHMP4BP1P59074 171 aa8.74□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 SLC51AQ86UW1 340 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 TMEM192Q8IY95 271 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.74□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 SLC6A18Q96N87 628 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 HACL1Q9UJ83 578 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.74□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 HIP1O00291 1037 aa8.73□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 TIMM10P62072 90 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.73□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 SLITRK5O94991 958 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 ETV3P41162 512 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 GRM1Q13255 1194 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 SKAP1Q86WV1 359 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 SP8Q8IXZ3 490 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 EVI5LQ96CN4 794 aa8.72□□□□□ -1.01
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HERC3-210ENST00000512194 EPN3Q9H201 632 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 LAMB2P55268 1798 aa8.71□□□□□ -1.01
HERC3-210ENST00000512194 B2RBV5 119 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 FZD9O00144 591 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 TAF5LO75529 589 aa8.71□□□□□ -1.02
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HERC3-210ENST00000512194 RNF4P78317 190 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
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HERC3-210ENST00000512194 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 EYA3Q99504 573 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 ZNF609O15014 1411 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 TAF1P21675 1872 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-210ENST00000512194 NAT2P11245 290 aa8.7□□□□□ -1.02
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