RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510403.5

SPOCK3-214, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, humanhuman

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 563 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3-214ENST00000510403 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 FERMT3Q86UX7 667 aa28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SPOCK3-214ENST00000510403 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 OR52Z1P0C646 297 aa28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 MARK3P27448 753 aa28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 NBR1Q14596 966 aa28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 PTGISQ16647 500 aa28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 NRCAMQ92823 1304 aa28.44■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 LAD1O00515 517 aa28.44■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 KIAA0355O15063 1070 aa28.44■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.44■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 POTEB3A0JP26 581 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 RESTQ13127 1097 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 PTGDRQ13258 359 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 PLCB4Q15147 1175 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 EPHA7Q15375 998 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 POTEBQ6S5H4 581 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 C4orf32Q8N8J7 132 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TRPC6Q9Y210 931 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.43■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 RRN3P2A6NIE6 340 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 H0YGN5 161 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 HBP1O60381 514 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 PPFIA1Q13136 1202 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 NCAPH2Q6IBW4 605 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 NRBP2Q9NSY0 501 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 SETD4Q9NVD3 440 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TBX21Q9UL17 535 aa28.42■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 EML1O00423 815 aa28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 RAG1P15918 1043 aa28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 SYN1P17600 705 aa28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 HOXC8P31273 242 aa28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 ATP8B4Q8TF62 1192 aa28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 FAM167AQ96KS9 214 aa28.41■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 BMP15O95972 392 aa28.4■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 P4HBP07237 508 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 INSRRP14616 1297 aa28.4■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 PSMC5P62195 406 aa28.4■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.4■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.4■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TIMP1P01033 207 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 CYP2C9P11712 490 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 ATP4AP20648 1035 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 PRPHP41219 470 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 TECP42680 631 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 QARSP47897 775 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 PTK7Q13308 1070 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 GRIK4Q16099 956 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 RAB34Q9BZG1 259 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 HIPK3Q9H422 1215 aa28.39■■■□□ 2.14
SPOCK3-214ENST00000510403 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 BFSP2Q13515 415 aa28.38■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.38■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 TREHO43280 583 aa28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 ADAM17P78536 824 aa28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 HIC1Q14526 733 aa28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 PDIA5Q14554 519 aa28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 DTHD1Q6ZMT9 781 aa28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 BANK1Q8NDB2 785 aa28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 NEK9Q8TD19 979 aa28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 COL1A2P08123 1366 aa28.37■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.36■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 ZNF862O60290 1169 aa28.36■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 OATP04181 439 aa28.36■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 IGBP1P78318 339 aa28.36■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 PRKCEQ02156 737 aa28.36■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 UGCGQ16739 394 aa28.36■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 XKR3Q5GH77 459 aa28.36■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 SERINC5Q86VE9 423 aa28.36■■■□□ 2.13
SPOCK3-214ENST00000510403 RETREG2Q8NC44 543 aa28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms