RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 OTOP2Q7RTS6 562 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 RIT2Q99578 217 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 TRPC6Q9Y210 931 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 MSH4O15457 936 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 DTNBO60941 627 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 THPOP40225 353 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 ADAM17P78536 824 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 ST3GAL1Q11201 340 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 GRIK4Q16099 956 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 INF2Q27J81 1249 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 NEK8Q86SG6 692 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 GJB4Q9NTQ9 266 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 LAMA3Q16787 3333 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-206ENST00000507253 EDIL3O43854 480 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 GAS7O60861 476 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 TDP2O95551 362 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 TAF2Q6P1X5 1199 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 WNT8BQ93098 351 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 ZNF302Q9NR11 478 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 ZBBXA8MT70 800 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 WDR64B1ANS9 1081 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 MMP1P03956 469 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 PSAPP07602 524 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 LETM2Q2VYF4 491 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 SLC5A5Q92911 643 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 MBOAT7Q96N66 472 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 UIMC1Q96RL1 719 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 RSPH10BP0C881 870 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 PLCB4Q15147 1175 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 PDXDC2PQ6P474 469 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 RSPH3Q86UC2 560 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 OXER1Q8TDS5 423 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 VWCEQ96DN2 955 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 SAMM50Q9Y512 469 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 POTEB3A0JP26 581 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 BAIAP3O94812 1187 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 CXCL10P02778 98 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 INSRRP14616 1297 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 SFNP31947 248 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 JAK3P52333 1124 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 ZNF697Q5TEC3 545 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 KRT40Q6A162 431 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 SWSAP1Q6NVH7 229 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 POTEBQ6S5H4 581 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 HBP1O60381 514 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 IGBP1P78318 339 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 RPAINQ86UA6 219 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 DEFB123Q8N688 67 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 ATP8B4Q8TF62 1192 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 COL1A2P08123 1366 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 TMEM265A0A087WTH1 108 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 MCM2P49736 904 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 FOSBP53539 338 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 NR5A1Q13285 461 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 RDM1Q8NG50 284 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 C8orf76Q96K31 380 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 DISC1Q9NRI5 854 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX1-206ENST00000507253 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 NBNO60934 754 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 EFCAB14O75071 495 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 PSMD10O75832 226 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 ETNPPLQ8TBG4 499 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 TNFRSF25Q93038 417 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 FAM167AQ96KS9 214 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 FAM20AQ96MK3 541 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 SLC9A7Q96T83 725 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa26.69■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 WDR81Q562E7 1941 aa26.69■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 CHMP2AO43633 222 aa26.69■■□□□ 1.86
PITX1-206ENST00000507253 CTSHP09668 335 aa26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms