RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488024.1

RASSF1-208, Transcript of Ras association domain family member 1, human

TSL 2

Gene RASSF1, Length 1,385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASSF1-208	ENST00000488024	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	PSAP	P07602	524 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	SFN	P31947	248 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	MFSD5	Q6N075	450 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	ZNF302	Q9NR11	478 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	DISC1	Q9NRI5	854 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	SETD4	Q9NVD3	440 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	VAV3	Q9UKW4	847 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RASSF1-208	ENST00000488024	NRCAM	Q92823	1304 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024		H3BQV1	296 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	BACH1	O14867	736 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	CYP2C18	P33260	490 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TRAPPC10	P48553	1259 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	JAK3	P52333	1124 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	PTK7	Q13308	1070 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	PLCB4	Q15147	1175 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	HSCB	Q8IWL3	235 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	RDM1	Q8NG50	284 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	CHMP2A	O43633	222 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	NEMF	O60524	1076 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	PPP2R5C	Q13362	524 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	SERINC5	Q86VE9	423 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	SAMM50	Q9Y512	469 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	PITPNM1	O00562	1244 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	GNAT1	P11488	350 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	ATP2B1	P20020	1258 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	ATP4A	P20648	1035 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	RBL2	Q08999	1139 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	MTMR9	Q96QG7	549 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TREH	O43280	583 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	PPFIA1	Q13136	1202 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	CALCRL	Q16602	461 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	MCTP1	Q6DN14	999 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	CAGE1	Q8TC20	777 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	WNT8B	Q93098	351 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	POTEB3	A0JP26	581 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	INSRR	P14616	1297 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	MCM7	P33993	719 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	FPGS	Q05932	587 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	BFSP2	Q13515	415 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	GRIK4	Q16099	956 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TTC38	Q5R3I4	469 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	POTEB	Q6S5H4	581 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	EML1	O00423	815 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	MARCH6	O60337	910 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	PDC	P20941	246 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	TRPC6	Q9Y210	931 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	SCN5A	Q14524	2016 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	CSF2RA	P15509	400 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	CCL23	P55773	120 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	ZNF174	Q15697	407 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RASSF1-208	ENST00000488024	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	ZNF862	O60290	1169 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	HBP1	O60381	514 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	EPHB4	P54760	987 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	UGCG	Q16739	394 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024		A0A1W2PPC1	479 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	IQCF3	P0C7M6	154 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	CKB	P12277	381 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	SYT1	P21579	422 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04	3e-10	■■■□□ 15.6
RASSF1-208	ENST00000488024	NBR1	Q14596	966 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	SCLY	Q96I15	445 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RASSF1-208	ENST00000488024	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms