RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 DPF3Q92784 378 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ST7Q9NRC1 585 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CPS1P31327 1500 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 EVC2Q86UK5 1308 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC7Q96M83 1385 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2A2P52657 109 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CAP1Q01518 475 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 VWA3BQ502W6 1294 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 EPN3Q9H201 632 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PTCH1Q13635 1447 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 NWD1Q149M9 1564 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SCG5P05408 212 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 KCNC1P48547 511 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 GFRA1P56159 465 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 HTRA3P83110 453 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CEP68Q76N32 757 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC103Q8IW40 242 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SEC14L1Q92503 715 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC140Q96MF4 163 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GTL3 188 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2C8P10632 490 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ATF3P18847 181 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 BCL6P41182 706 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SLURP1P55000 103 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 DDR2Q16832 855 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 MROH9Q5TGP6 573 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 LIPIQ6XZB0 460 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP10Q86W26 655 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 DDX11Q96FC9 970 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM169Q96HH4 297 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 ORAI2Q96SN7 254 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 PANK3Q9H999 370 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-211ENST00000484135 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SGSM2O43147 1006 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 LTBRP36941 435 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A11P48066 632 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R2AP63151 447 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA25Q9BR10 227 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 USP40Q9NVE5 1235 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 C8BP07358 591 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 LCP1P13796 627 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N1Y9 231 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CXorf38Q8TB03 319 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 NOX5Q96PH1 765 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 GMLQ99445 158 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 IER2Q9BTL4 223 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 PALD1Q9ULE6 856 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 X6R8D5 127 aa6.38□□□□□ -1.39
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