RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GOLIM4	O00461	696 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GSTM1	P09488	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	HSD3B1	P14060	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GPR3	P46089	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	RENBP	P51606	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	USP14	P54578	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LSAMP	Q13449	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	NME9	Q86XW9	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TBATA	Q96M53	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KDM4C-208	ENST00000480996	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996		H3BML4	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	SYP	P08247	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	POU2F2	P09086	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GNAT1	P11488	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	IL12RB1	P42701	662 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ELF2	Q15723	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GPR19	Q15760	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	INF2	Q27J81	1249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GATA6	Q92908	595 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	IPP	Q9Y573	584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	EXOC5	O00471	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TGM5	O43548	720 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	WFS1	O76024	890 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PDE6A	P16499	860 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	KRT15	P19012	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC9A1	P19634	815 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ENPP1	P22413	925 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GRK6	P43250	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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