RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480155.1

SHOC2-204, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 2

Gene SHOC2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-204	ENST00000480155	SYN1	P17600	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	KCNC1	P48547	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	SLURP1	P55000	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	TRAF5	O00463	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	MC4R	P32245	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	GLRB	P48167	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PFKP	Q01813	784 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155		B4E1Z4	1266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	MME	P08473	750 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	NEK4	P51957	841 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	GYS2	P54840	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	IRF9	Q00978	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CAP1	Q01518	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CBX4	O00257	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	DVL2	O14641	736 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	NPTXR	O95502	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	IL18BP	O95998	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	GJA4	P35212	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CARF	Q8N187	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	DLG3	Q92796	817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	NTM	Q9P121	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155		A0A087X0B3	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CELA3B	P08861	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF28	P17035	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	HSD3B2	P26439	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	AOAH	P28039	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	FLT3	P36888	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHOC2-204	ENST00000480155	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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