RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-204ENST00000466539 NEK1Q96PY6 1258 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 MXD3Q9BW11 206 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 JAG2Q9Y219 1238 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 FLT1P17948 1338 aa7.27□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 HMX2A2RU54 273 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SMIM22K7EJ46 135 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 BAG3O95817 575 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 LMNB1P20700 586 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PSMA5P28066 241 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NTF4P34130 210 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ASPAP45381 313 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 CRKP46108 304 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PPARAQ07869 468 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 UVSSAQ2YD98 709 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SHISA5Q8N114 240 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ANKS1AQ92625 1134 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 TEKT1Q969V4 418 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NEDD4P46934 1319 aa7.26□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 CNTNAP1P78357 1384 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 FAM221AA4D161 298 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ZNF213O14771 459 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 DYRK3O43781 588 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ADAM23O75077 832 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 F13A1P00488 732 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NFICP08651 508 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 CASTP20810 708 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 LIFRP42702 1097 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NEK4P51957 841 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 RCAN1P53805 252 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 AK2P54819 239 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 LMNB2Q03252 620 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 TTLL4Q14679 1199 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SEC23AQ15436 765 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PPM1JQ5JR12 505 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NIM1KQ8IY84 436 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NAPBQ9H115 298 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 RAXQ9Y2V3 346 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.25□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 GFRA2O00451 464 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ENTPD3O75355 529 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 RAB6AP20340 208 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 PLCD1P51178 756 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 USP11P51784 963 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NFIAQ12857 509 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 BEND4Q6ZU67 534 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 FAM83AQ86UY5 434 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 GPC2Q8N158 579 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 NCOA7Q8NI08 942 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 FBXO27Q8NI29 283 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 RNF34Q969K3 372 aa7.24□□□□□ -1.25
PSME4-204ENST00000466539 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms