RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF286BP0CG31 522 aa29.75■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CST5P28325 142 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM50Q86XT4 487 aa29.75■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 ARRDC4Q8NCT1 418 aa29.75■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 GLG1Q92896 1179 aa29.75■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 HSD17B14Q9BPX1 270 aa29.75■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 LGR5O75473 907 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 P4HBP07237 508 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 STAT5BP51692 787 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM160B1Q5W0V3 765 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CABP7Q86V35 215 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 NEK9Q8TD19 979 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 EMSYQ7Z589 1322 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 MED24O75448 989 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 SGPL1O95470 568 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 KCNA10Q16322 511 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 UGCGQ16739 394 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 TPH2Q8IWU9 490 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 LXNQ9BS40 222 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 SLITRK3O94933 977 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 RPA1P27694 616 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 TXLNAP40222 546 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 QARSP47897 775 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 PDXDC2PQ6P474 469 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 ATP6V0A1Q93050 837 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 C16orf70Q9BSU1 422 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 TUFT1Q9NNX1 390 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 KPNA6O60684 536 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 PSMC5P62195 406 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 RESP18Q5W5W9 173 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 POTEB3A0JP26 581 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 ASGR1P07306 291 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CMA1P23946 247 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 PURAQ00577 322 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 POTEBQ6S5H4 581 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 CXCL17Q6UXB2 119 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM13BQ9NYF5 915 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
GGTA1P-201ENST00000373793 A0A1W2PQ27 194 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 A0A1W2PQ64 194 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 A0A1W2PQD8 194 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 GOLGA6L22H0YM25 854 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 MARK3P27448 753 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 GJA8P48165 433 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 ECM1Q16610 540 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 CALML4Q96GE6 196 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 PLIN2Q99541 437 aa29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 KBTBD13C9JR72 458 aa29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 H3BRB1 525 aa29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 POTEGQ6S5H5 508 aa29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 CKAP2LQ8IYA6 745 aa29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 ERAP1Q9NZ08 941 aa29.69■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 DNM1LO00429 736 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF862O60290 1169 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 F2P00734 622 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 FSIP1Q8NA03 581 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 KAT2BQ92831 832 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 PNMA5Q96PV4 448 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC39Q9UFE4 941 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 KIAA1024Q9UPX6 916 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 A0A1B0GVL5 298 aa29.67■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 ATP4AP20648 1035 aa29.67■■■□□ 2.34
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC26A2P50443 739 aa29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms