RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX5P35711 763 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 RAP1GAPP47736 663 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SCNN1BP51168 640 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 DSG1Q02413 1049 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM129CQ86XR2 697 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 NOX5Q96PH1 765 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD3Q9Y597 815 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 GAS7O60861 476 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 HIP1RO75146 1068 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 PI3P19957 117 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNA10Q16322 511 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CD276Q5ZPR3 534 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CREB3L3Q68CJ9 461 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 LIPIQ6XZB0 460 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 STK32CQ86UX6 486 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 OXSMQ9NWU1 459 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 RASSF10A6NK89 507 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 H7C1D1 291 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF11P52732 1056 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGA1P56199 1179 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 HERVK_113P62684 666 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 HTRA3P83110 453 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM9Q13443 819 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 DHCR24Q15392 516 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CNKSR3Q6P9H4 555 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 PWWP2AQ96N64 755 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 MMEP08473 750 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC9A1P19634 815 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CNGA1P29973 690 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SDHAP31040 664 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 THBS2P35442 1172 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00310P59036 64 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 PFKPQ01813 784 aa5.48□□□□□ -1.53
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RABGGTB-202ENST00000370826 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF174Q15697 407 aa5.48□□□□□ -1.53
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RABGGTB-202ENST00000370826 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 VASNQ6EMK4 673 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 DTX3Q8N9I9 347 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 KYQ8NBH2 561 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM209Q96SK2 561 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC39A2Q9NP94 309 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ACSS2Q9NR19 701 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 BTBD7Q9P203 1132 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD62A6NC57 917 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF839A8K0R7 811 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGGTB-202ENST00000370826 FKBP9O95302 570 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 BPIP17213 487 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 AOAHP28039 575 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 NFKB2Q00653 900 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 TTLL6Q8N841 843 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB15Q8WXK1 588 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 USP7Q93009 1102 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-202ENST00000370826 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.47□□□□□ -1.53
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