RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 C21orf2O43822 256 aa26.3■■□□□ 1.8
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AMIGO1-201ENST00000369862 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.3■■□□□ 1.8
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AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA6DP0CG33 693 aa26.29■■□□□ 1.8
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AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa26.29■■□□□ 1.8
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AMIGO1-201ENST00000369862 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
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AMIGO1-201ENST00000369862 MSH4O15457 936 aa26.27■■□□□ 1.8
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AMIGO1-201ENST00000369862 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.27■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.27■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 SPDYE6P0CI01 402 aa26.27■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 RPA1P27694 616 aa26.27■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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AMIGO1-201ENST00000369862 ACER1Q8TDN7 264 aa26.27■■□□□ 1.8
AMIGO1-201ENST00000369862 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.27■■□□□ 1.8
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AMIGO1-201ENST00000369862 SH3GL2Q99962 352 aa26.26■■□□□ 1.79
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AMIGO1-201ENST00000369862 VAV3Q9UKW4 847 aa26.26■■□□□ 1.79
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AMIGO1-201ENST00000369862 ERMNQ8TAM6 284 aa26.25■■□□□ 1.79
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AMIGO1-201ENST00000369862 REEP2Q9BRK0 252 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 TLR10Q9BXR5 811 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 DNM3Q9UQ16 869 aa26.23■■□□□ 1.79
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