RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-202ENST00000361368 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 STXBP2Q15833 593 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 CDK8P49336 464 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 TMED2Q15363 201 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.87■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 PLTPP55058 493 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 TAC1P20366 129 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 HOXD10P28358 340 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.86■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 DPYSL4O14531 572 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 SLC35F6Q8N357 371 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 GIPC2Q8TF65 315 aa21.86■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 PHKA2P46019 1235 aa21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 MECOMQ03112 1051 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 DGKHQ86XP1 1220 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 CSPG5O95196 566 aa21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 PROSER3Q2NL68 480 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 URGCPQ8TCY9 931 aa21.85■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.85■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.84■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.84■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.84■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 NLRP1Q9C000 1473 aa21.83■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 MX2P20592 715 aa21.83■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 ATG16L1Q676U5 607 aa21.83■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 LRRC31Q6UY01 552 aa21.83■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 NNMTP40261 264 aa21.83■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.83■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.83■■□□□ 1.09
SMURF1-202ENST00000361368 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.83■■□□□ 1.09
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SMURF1-202ENST00000361368 ATP8B1O43520 1251 aa21.83■■□□□ 1.08
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SMURF1-202ENST00000361368 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.08
SMURF1-202ENST00000361368 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.83■■□□□ 1.08
SMURF1-202ENST00000361368 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SMURF1-202ENST00000361368 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.83■■□□□ 1.08
SMURF1-202ENST00000361368 CLTAP09496 248 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF1-202ENST00000361368 PSMA2P25787 234 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF1-202ENST00000361368 KRT39Q6A163 491 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF1-202ENST00000361368 CFAP36Q96G28 342 aa21.82■■□□□ 1.08
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC138Q96M89 665 aa21.82■■□□□ 1.08
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