RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323319.6

CLDN22-201, Transcript of claudin 22, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN22, Length 2,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22-201ENST00000323319 SH2D4AQ9H788 454 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 JADE2Q9NQC1 790 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 A0A1W2PRG0 241 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MEIS1O00470 390 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ERLIN2O94905 339 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 PSMC6P62333 389 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 TRIM58Q8NG06 486 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CNKSR1Q969H4 720 aa16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 TACC1O75410 805 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 RPA1P27694 616 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CAGE1Q8TC20 777 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 KAT2BQ92831 832 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CEP72Q9P209 647 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 DNM3Q9UQ16 869 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CEP83Q9Y592 693 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 OPLAHO14841 1288 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 FAM20AQ96MK3 541 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MYH10P35580 1976 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF185O15231 689 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MSH4O15457 936 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 USP14P54578 494 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ADAM9Q13443 819 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 GIT2Q14161 759 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 WDR93Q6P2C0 686 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 NOL4O94818 638 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MOCS3O95396 460 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CIITAP33076 1130 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MAP2K2P36507 400 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MAGEA1P43355 309 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CASP5P51878 434 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 REEP2Q9BRK0 252 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 YDJCA8MPS7 323 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 PPIP5K2O43314 1243 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF76P36508 570 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 LIG3P49916 1009 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CYP4A11Q02928 519 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 HGSNATQ68CP4 663 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 CETN3O15182 167 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 EPS15P42566 896 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SFR1Q86XK3 245 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 STK24Q9Y6E0 443 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 NR2F2P24468 414 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ECE1P42892 770 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 MNAT1P51948 309 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 STAT2P52630 851 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 DONSONQ9NYP3 566 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 VAV3Q9UKW4 847 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SNX12Q9UMY4 172 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 TLR2O60603 784 aa16.9■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 APBA1Q02410 837 aa16.9■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.9■□□□□ 0.3
CLDN22-201ENST00000323319 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms