RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.68■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ISM2Q6H9L7 571 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAD54LQ92698 747 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SENP7Q9BQF6 1050 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HTTP42858 3142 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR25O00155 361 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AP5Z1O43299 807 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FLT3LGP49771 235 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACTR2P61160 394 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CUL4BQ13620 913 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LXNQ9BS40 222 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VTA1Q9NP79 307 aa26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR81Q562E7 1941 aa26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR64B1ANS9 1081 aa26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TGFB3P10600 412 aa26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCB2Q00722 1185 aa26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.66■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADCY6O43306 1168 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACVR2BQ13705 512 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCFD2Q8WU76 684 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BECN2A8MW95 431 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HS1BP3Q53T59 392 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMARCE1Q969G3 411 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STK17AQ9UEE5 414 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.65■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JAK3P52333 1124 aa26.64■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPYDQ12882 1025 aa26.64■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEDD9Q14511 834 aa26.64■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTLL4Q14679 1199 aa26.64■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM150BA6NC51 233 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGHA2P01877 340 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 P4HBP07237 508 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF22Q14807 665 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABHD15Q6UXT9 468 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA20Q8TB22 786 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMC2O95347 1197 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLA2G4BP0C869 781 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SFNP31947 248 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC144BQ3MJ40 725 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SWSAP1Q6NVH7 229 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNV1Q6PIU1 500 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 METTL7BQ6UX53 244 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIB2Q92519 343 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CUEDC2Q9H467 287 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GABBR1Q9UBS5 961 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STK24Q9Y6E0 443 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYMKA6NI61 221 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMPD1P17405 629 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OLFML2BQ68BL8 750 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SV2BQ7L1I2 683 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.62■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.61■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNM3Q9UQ16 869 aa26.61■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC26A4O43511 780 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC12A3P55017 1021 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP1Q07960 439 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM32Q13049 653 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF862O60290 1169 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATG7O95352 703 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSAPP07602 524 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DYMQ7RTS9 669 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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