RNA–Protein interactions for RNA: YPL178W

CBC2, Transcript of Small subunit of the heterodimeric cap binding complex with Sto1p, yeast

Gene CBC2, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBC2	YPL178W	PDR3	P33200	976 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	LST4	P34239	828 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	DOA1	P36037	715 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YHR210C	P38893	341 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	GAB1	P41733	394 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	PTR3	P43606	678 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	USE1	P53146	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	COG2	P53271	262 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	SPC24	Q04477	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	GTB1	Q04924	702 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RPN6	Q12377	434 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YPR096C	O13587	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	UNG1	P12887	359 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	TOP3	P13099	656 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	PHO81	P17442	1178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	ATP7	P30902	174 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	ZIP1	P31111	875 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	DGR2	P32330	852 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	PUP2	P32379	260 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	DCG1	P32460	244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MKK2	P32491	506 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	NUP2	P32499	720 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	SEC17	P32602	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MRPL17	P36528	281 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	IFA38	P38286	347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	TSC10	P38342	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	VPS52	P39904	641 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	IMA5	P40884	581 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MRPS18	P42847	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	GTR1	Q00582	310 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	TRS23	Q03784	219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	PUN1	Q06991	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YIG1	Q08956	461 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YPR202W	Q08993	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	FRE7	Q12333	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	SNF8	Q12483	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	LDB16	P25587	256 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	FZO1	P38297	855 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RPS27B	P38711	82 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	TRM5	P38793	499 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	STE24	P47154	453 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	DIA3	P52290	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	PEX25	Q02969	394 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MSC1	Q03104	513 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	DYN3	Q04949	312 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YDR338C	Q05497	695 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YPL278C	Q08990	100 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	ARG81	P05085	880 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	ARG3	P05150	338 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	ALG7	P07286	448 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	DAP2	P18962	818 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	APN1	P22936	367 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MSN2	P33748	704 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	VPS51	P36116	164 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	BET3	P36149	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	SCO2	P38072	301 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	IST2	P38250	946 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MBP1	P39678	833 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	FMP52	P40008	231 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MIG2	P53035	382 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	RAD33	Q04231	177 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	HSP31	Q04432	237 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	BCP1	Q06338	283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YLR036C	Q07986	203 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YOL024W	Q08172	172 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MUM3	Q08750	479 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	MCH5	Q08777	521 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	FDH1	Q08911	376 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	REX3	Q12090	404 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	YOR019W	Q99248	730 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBC2	YPL178W	ATP6	P00854	259 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBC2	YPL178W	RAP1	P11938	827 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBC2	YPL178W	STE6	P12866	1290 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBC2	YPL178W	RPB5	P20434	215 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBC2	YPL178W	MXR2	P25566	168 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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