RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W MNT4P53745 580 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PET117Q02771 107 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YDR109CQ04585 715 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W GTO3Q04806 366 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ECM7Q06200 448 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W VAC14Q06708 880 aa3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RHO2P06781 192 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W THR4P16120 514 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W FUS3P16892 353 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YIM1P28625 365 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RME1P32338 300 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MGM101P32787 269 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W PPZ2P33329 710 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W HES1P35843 434 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W OLA1P38219 394 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W TAE1P38340 232 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ARP1P38696 384 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W ELO1P39540 310 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YER130CP39959 443 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MOB1P40484 314 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W FMC1P40491 155 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YRB2P40517 327 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MSS2P40990 351 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MSY1P48527 492 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YNL146WP53906 100 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W EKI1Q03764 534 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W URC2Q04411 772 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W RRG8Q06109 277 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W GPN3Q06543 272 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W YLL007CQ07799 665 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W TGS1Q12052 315 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W APC2Q12440 853 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W SFG1Q12507 346 aa3.97□□□□□ -1.77
PIR3YKL163W COX1P00401 534 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PUT2P07275 575 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PEP5P12868 1029 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ALG1P16661 449 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MAK31P23059 88 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RPI1P23250 407 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YCL068CP25593 260 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W GEX1P25596 615 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ERG1P32476 496 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CYM1P32898 989 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W BUD2P33314 1104 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YKL097CP34245 136 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ECM4P36156 370 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MRPL7P36519 292 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W VHC1P38329 1120 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CBR1P38626 284 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CIN4P39110 191 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YER085CP40058 173 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W LAS21P40367 830 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ATM1P40416 690 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CSM2P40465 213 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W BAP3P41815 604 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W LOH1P47055 219 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MRK1P50873 501 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YGR126WP53274 230 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W FHN1P53279 174 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W COQ6P53318 479 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YMR102CQ03177 834 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CAB5Q03941 241 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W IPK1Q06667 281 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W IZH3Q07959 543 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YPL216WQ08964 1102 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W RRD2Q12461 358 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa3.96□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W PRB1P09232 635 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ABF1P14164 731 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W KIN3P22209 435 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W ADY2P25613 283 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W GAC1P28006 793 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W LAC1P28496 418 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W BEM1P29366 551 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CDC5P32562 705 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W SRB4P32569 687 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YBR139WP38109 508 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W CTP1P38152 299 aa3.95□□□□□ -1.78
PIR3YKL163W YMR262WP38430 313 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.9 ms