RNA–Protein interactions for RNA: YHR116W

COX23, Transcript of Protein that functions in mitochondrial copper homeostasis, yeast

Gene COX23, Length 456 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX23	YHR116W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	MTH1	P35198	433 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	MRPL15	P36523	253 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	ETR1	P38071	380 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	SIC1	P38634	284 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	MUP3	P38734	546 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	REV7	P38927	245 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	YJR030C	P47101	745 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	YGR266W	P53326	701 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	VHS1	Q03785	461 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	YMR155W	Q03795	547 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	RSF1	Q05043	376 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	ARR3	Q06598	404 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	YET3	Q07451	203 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	PSR1	Q07800	427 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	YOL073C	Q08232	322 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	ATG29	Q12092	213 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	UBX3	Q12229	455 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	PST1	Q12355	444 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	SWM1	Q12379	170 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	POM34	Q12445	299 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COX23	YHR116W	STE3	P06783	470 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	CDC21	P06785	304 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PDX1	P16451	410 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	RPO26	P20435	155 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YCR006C	P25350	157 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	ADE1	P27616	306 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	MRP20	P32387	263 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SRB5	P32585	307 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
COX23	YHR116W	PTM1	P32857	523 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SOL2	P37262	315 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	COS111	P38308	924 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	INM1	P38710	295 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SPC97	P38863	823 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	GGC1	P38988	300 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	ECM1	P39715	212 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YFR020W	P43600	232 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	TEL2	P53038	688 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SGF73	P53165	657 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	BSC5	P53755	489 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YNL260C	P53846	198 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SUR7	P54003	302 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YSA1	Q01976	231 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	ATG21	Q02887	496 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	GOT1	Q03554	138 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	AIM6	Q07716	390 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	MDY2	Q12285	212 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	GLE1	Q12315	538 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	RGS2	Q99188	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	TYR1	P20049	452 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YCK1	P23291	538 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	ERG8	P24521	451 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	LDB16	P25587	256 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SIN4	P32259	974 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PHA2	P32452	334 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	DCG1	P32460	244 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	CYM1	P32898	989 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	LST4	P34239	828 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	KKQ8	P36004	724 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	MRPL36	P36531	177 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	FTH1	P38310	465 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	RPP1	P38786	293 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	APE4	P38821	490 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PLB1	P39105	664 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PEP8	P40335	379 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YIL086C	P40503	102 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	YIL077C	P40508	320 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	AXL1	P40851	1208 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	ELP2	P42935	788 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SHY1	P53266	389 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	RCF2	P53721	224 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COX23	YHR116W	SED5	Q01590	340 aa		3.07	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms