RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	SPO16	P17122	198 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SNT1	P25357	1226 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YCR101C	P25607	182 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	NUP2	P32499	720 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ORC2	P32833	620 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PTM1	P32857	523 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SKG1	P36169	355 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YBP1	P38315	674 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	POP2	P39008	433 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YMR134W	P40207	237 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ASG1	P40467	964 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	BST1	P43571	1029 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YJR030C	P47101	745 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CCC1	P47818	322 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YGR021W	P53212	290 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	COQ6	P53318	479 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	BUD17	P53727	317 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YNL018C	P53976	612 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RSC9	Q03124	581 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PFA5	Q03289	374 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TDA9	Q04545	1251 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	GRX6	Q12438	231 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YPR1	Q12458	312 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		3.29	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	APC1	P53886	1748 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	FOB1	O13329	566 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	INH1	P01097	85 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SPT3	P06844	337 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CHS1	P08004	1131 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MAS1	P10507	462 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ERG11	P10614	530 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	APA2	P22108	325 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RRT12	P25381	491 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	HYM1	P32464	399 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MEI5	P32489	222 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	LOT5	P34234	306 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SPC34	P36131	295 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CHK1	P38147	527 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ECM13	P38195	257 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	FMP23	P38231	175 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	BMT2	P38278	337 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	STB5	P38699	743 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ECM10	P39987	644 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	EAF5	P39995	279 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	KRE29	P40026	464 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	AGX1	P43567	385 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PMT5	P52867	743 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	HOL1	P53389	586 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	FOL1	P53848	824 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CWC27	Q02770	301 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ARL3	Q02804	198 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CIA1	Q05583	330 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	FAR10	Q06001	478 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SPH1	Q06160	661 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	GRS2	Q06817	618 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	THI3	Q07471	609 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ZEO1	Q08245	113 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	IMA2	Q08295	589 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PGC1	Q08959	321 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YPR202W	Q08993	238 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TGS1	Q12052	315 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YOR342C	Q12182	319 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MED11	Q99278	115 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.2 ms