RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SPR1	P32603	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	AGP2	P38090	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YBR139W	P38109	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SWC5	P38326	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	FHL1	P39521	936 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SER3	P40054	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
ACT1	YFL039C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	MPS2	P53159	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	DIA1	P54005	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	INA17	Q02888	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	THI3	Q07471	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	FRE3	Q08905	711 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	BTS1	Q12051	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	FMP16	Q12497	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	NCB2	Q92317	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
ACT1	YFL039C	GAL4	P04386	881 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	MSF1	P08425	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YSP3	P25036	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	PBN1	P25580	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	TMT1	P32643	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	VMA22	P38784	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YIL001W	P40560	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ORC5	P50874	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ICT1	Q12385	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
ACT1	YFL039C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ZRC1	P20107	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SAG1	P20840	650 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RBK1	P25332	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	KRE2	P27809	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	PPA2	P28239	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	NUF2	P33895	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ARN1	P38731	627 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ATM1	P40416	690 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YIL024C	P40543	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	CTK2	P46962	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YPR003C	P53394	754 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YNL260C	P53846	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	VAC7	P53950	1165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	MRS2	Q01926	470 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	FIN1	Q03898	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	CAB5	Q03941	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	STP3	Q05937	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	CTS2	Q06350	511 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	RTT109	Q07794	436 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	BSC6	Q08280	497 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	INP53	Q12271	1107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ATG31	Q12421	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SEY1	Q99287	776 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACT1	YFL039C	SWI1	P09547	1314 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	PDE2	P06776	526 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	URA4	P20051	364 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	DAL2	P25335	343 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	CIN8	P27895	1000 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	TUL1	P36096	758 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	FES1	P38260	290 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	FAD1	P38913	306 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	SHC1	P39000	512 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	IME4	P41833	600 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	IBA57	P47158	497 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	COS5	P47187	383 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACT1	YFL039C	DIA3	P52290	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 89.3 ms