RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ARL8A	Q96BM9	186 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SHISA4	Q96DD7	197 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	KCND1	Q9NSA2	647 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	TSKS	Q9UJT2	592 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SEC24C	P53992	1094 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR59	Q6PJI9	974 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ANO3	Q9BYT9	981 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PLAA	Q9Y263	795 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC172	P0C7W6	258 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	NR1D1	P20393	614 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SH2D4A	Q9H788	454 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	AMACR	Q9UHK6	382 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SEPT2	Q15019	361 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	GJB7	Q6PEY0	223 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	COPB2	P35606	906 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC31	Q6UY01	552 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	UST	Q9Y2C2	406 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	FLT1	P17948	1338 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A087X0T9	212 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	GNA14	O95837	355 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	FGG	P02679	453 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM228B	P0C875	321 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PDHB	P11177	359 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	GRB10	Q13322	594 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SBK1	Q52WX2	424 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PDXDC1	Q6P996	788 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNK18	Q7Z418	384 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJC7	Q99615	494 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	TOM1	O60784	492 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	MTMR8	Q96EF0	704 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	CALCOCO2	Q13137	446 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA20	Q8TB22	786 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	AMN	Q9BXJ7	453 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PRG0	241 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF4A	O95239	1232 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	IRAK1	P51617	712 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SNX1	Q13596	522 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	NSMF	Q6X4W1	530 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	CTNNA2	P26232	953 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	OGFOD1	Q8N543	542 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ZIM3	Q96PE6	472 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SNX24	Q9Y343	169 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	EMB	Q6PCB8	327 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	DPH6	Q7L8W6	267 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	TCHP	Q9BT92	498 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB5	O15062	677 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-223	ENST00000639525	DAPK3	O43293	454 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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