RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	PHF19	Q5T6S3	580 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	NSMF	Q6X4W1	530 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	LBX2	Q6XYB7	198 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TIAM1	Q13009	1591 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	B4GALT3	O60512	393 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TMEM209	Q96SK2	561 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF536	O15090	1300 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	LTF	P02788	710 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	GRK2	P25098	689 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	GRK3	P35626	688 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	PROSER1	Q86XN7	944 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	MBD6	Q96DN6	1003 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	LOXL4	Q96JB6	756 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	GPR20	Q99678	358 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ADAM17	P78536	824 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TUSC3	Q13454	348 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ARID1B-231	ENST00000637887	ASXL2	Q76L83	1435 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	NES	P48681	1621 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	GNAT1	P11488	350 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23	5e-6	■□□□□ 8.5
ARID1B-231	ENST00000637887	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	BORCS6	Q96GS4	357 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	C8orf49	Q96NF6	230 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CYP7B1	O75881	506 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	GPR85	P60893	370 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	STYK1	Q6J9G0	422 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	SPATC1	Q76KD6	591 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	SOD2	P04179	222 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	COL6A1	P12109	1028 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	VASN	Q6EMK4	673 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	SAMD11	Q96NU1	681 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	WRNIP1	Q96S55	665 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	IPPK	Q9H8X2	491 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23	6e-6	■□□□□ 9.1
ARID1B-231	ENST00000637887	LAMTOR5	O43504	91 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CKM	P06732	381 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	FAH	P16930	419 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	DSE	Q9UL01	958 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PBRM1	Q86U86	1689 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	GLRB	P48167	497 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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