RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FZD5	Q13467	585 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF2H3	Q13889	308 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM240	Q5SV17	173 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR158	Q5T848	1215 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM192	Q8IY95	271 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PDILT	Q8N807	584 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616		U3KQE9	123 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WZG4	1122 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ERC2	O15083	957 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMM44	O43615	452 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MT-CO1	P00395	513 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	EPHX1	P07099	455 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FOSL1	P15407	271 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	OXCT1	P55809	520 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GJA9	P57773	515 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRE	P78334	506 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	STK3	Q13188	491 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	KCTD2	Q14681	263 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT72	Q14CN4	511 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SKAP1	Q86WV1	359 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF141	Q8WVD5	230 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	VWCE	Q96DN2	955 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	VTA1	Q9NP79	307 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF112	Q9ULX5	631 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ZMYM3	Q14202	1370 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR33	A8MZF0	331 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PRRT4	C9JH25	899 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCAB14	O75071	495 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC3A	O75596	197 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP2C19	P33261	490 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC174	Q6PII3	467 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC17	Q96AE7	1141 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	LRGUK	Q96M69	825 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC6A18	Q96N87	628 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MROH2A	A6NES4	1674 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCC3	O15438	1527 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	BLACE	A4D250	179 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CBX7	O95931	251 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	LTF	P02788	710 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NAT2	P11245	290 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CCND1	P24385	295 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR3DL1	P43629	444 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SCNN1B	P51168	640 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ODF1	Q14990	250 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXL18	Q96ME1	805 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SCLT1	Q96NL6	688 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	AIFM3	Q96NN9	605 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	HAUS7	Q99871	368 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ASPN	Q9BXN1	380 aa		6.05	□□□□□ -1.44

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