RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRT-211ENST00000618610 C5orf60A6NFR6 353 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 STXBP3O00186 592 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MMP1P03956 469 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CSF1RP07333 972 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SLC5A1P13866 664 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEA1P43355 309 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RASGRF1Q13972 1273 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GRIK5Q16478 980 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC178Q5BJE1 867 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 UCMAQ8WVF2 138 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LPIN2Q92539 896 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MTRQ99707 1265 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 KRT23Q9C075 422 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TAF1P21675 1872 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 USP54Q70EL1 1684 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LGALS16A8MUM7 142 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 COQ9O75208 318 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC38Q502W7 563 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CNKSR1Q969H4 720 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 H0YGN5 161 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SMAPO00193 183 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PPFIA2O75334 1257 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RARAP10276 462 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GHRP10912 638 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 IFNAR1P17181 557 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SLC1A4P43007 532 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SLCO1A2P46721 670 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRT-211ENST00000618610 KIF11P52732 1056 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SPAG1Q07617 926 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CUL3Q13618 768 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CD302Q8IX05 232 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RETREG2Q8NC44 543 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GSDMAQ96QA5 445 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRT-211ENST00000618610 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM75PA6NK02 468 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RIMBP2O15034 1052 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SEMA3EO15041 775 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GNPATO15228 680 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DAPK3O43293 454 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 XBP1P17861 261 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CYP7A1P22680 504 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RAD23BP54727 409 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ARID5AQ03989 594 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PDE8AO60658 829 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V1G1O75348 118 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PALMO75781 387 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 DEXIO95424 95 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZBED6P86452 979 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 FANCBQ8NB91 859 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 CCND1P24385 295 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 LIFRP42702 1097 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-211ENST00000618610 MSH2P43246 934 aa8.94□□□□□ -0.98
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