RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 MYL3P08590 195 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 TGFB3P10600 412 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 CCND2P30279 289 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 CTHP32929 405 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 ARHGAP1Q07960 439 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PGM5Q15124 567 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 QPCTQ16769 361 aa11.68□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 APOA5Q6Q788 366 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM199Q8N511 208 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 COPS5Q92905 334 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 KCNB2Q92953 911 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.68□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.67□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 ST8SIA5O15466 376 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 B4GALT4O60513 344 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 STAM2O75886 525 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 REC8O95072 547 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 RCAN1P53805 252 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 EPHB4P54760 987 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 WNT7BP56706 349 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 LAMC2Q13753 1193 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 ADCK5Q3MIX3 580 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 DESI1Q6ICB0 168 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 AFG1LQ8WV93 481 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 CUL5Q93034 780 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 HIPK3Q9H422 1215 aa11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 MEIS2O14770 477 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 MMP3P08254 477 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 RXRAP19793 462 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 HSPA4P34932 840 aa11.66□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 KCNH2Q12809 1159 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 DGKDQ16760 1214 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.66□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 MICU3Q86XE3 530 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 TEX2Q8IWB9 1127 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 DEFB123Q8N688 67 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 IL31RAQ8NI17 732 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PPTC7Q8NI37 304 aa11.66□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.66□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 ZBTB43O43298 467 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 CYP2C18P33260 490 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 GNPTABQ3T906 1256 aa11.65□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 FBXL16Q8N461 479 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.65□□□□□ -0.54
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UBXN8-208ENST00000616306 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.65□□□□□ -0.54
UBXN8-208ENST00000616306 PPFIA4O75335 1185 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 ICAM3P32942 547 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RTN1Q16799 776 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM240Q5SV17 173 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.64□□□□□ -0.55
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