RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.095e-6■■■■■ 35.2
CTDP1-208ENST00000613122 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 KDM6BO15054 1643 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 BRD3Q15059 726 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 MCF2LO15068 1137 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.86■■□□□ 1.09
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CTDP1-208ENST00000613122 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 PDE1BQ01064 536 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 WDR64B1ANS9 1081 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 GFPT2O94808 682 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 PEX3P56589 373 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 CHD1O14646 1710 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP4P98171 946 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 RAPH1Q70E73 1250 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.85■■□□□ 1.09
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CTDP1-208ENST00000613122 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 INPP5BP32019 993 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 UTYO14607 1347 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 KCTD6Q8NC69 237 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 PRPSAP2O60256 369 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 RASSF2P50749 326 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 INHBAP08476 426 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 PCK1P35558 622 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 GPSM2P81274 684 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 DNAAF3Q8N9W5 541 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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CTDP1-208ENST00000613122 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.84■■□□□ 1.09
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CTDP1-208ENST00000613122 POTEDQ86YR6 584 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.83■■□□□ 1.09
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 TNFAIP2Q03169 654 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 THAP9Q9H5L6 903 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 RNF146Q9NTX7 359 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-208ENST00000613122 CIITAP33076 1130 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP25P42331 645 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 PHKA2P46019 1235 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 TTLL4Q14679 1199 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 MMP19Q99542 508 aa21.83■■□□□ 1.08
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CTDP1-208ENST00000613122 PRELPP51888 382 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 DENND3A2RUS2 1198 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 SP8Q8IXZ3 490 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 CALN1Q9BXU9 219 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 EFCC1Q9HA90 598 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 CPP00450 1065 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 IGKV5-2P06315 115 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 EPHB1P54762 984 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 RBL2Q08999 1139 aa21.82■■□□□ 1.08
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