RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611205.4

CDKN3-211, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CDKN3, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-211ENST00000611205 MCM5P33992 734 aa28.04■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 ADAM17P78536 824 aa28.04■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 EPC2Q52LR7 807 aa28.04■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 APBB2Q92870 758 aa28.04■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 SAMD11Q96NU1 681 aa28.04■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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CDKN3-211ENST00000611205 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
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CDKN3-211ENST00000611205 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.03■■■□□ 2.08
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CDKN3-211ENST00000611205 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.03■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
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CDKN3-211ENST00000611205 PTPROQ16827 1216 aa28.02■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 TMTC2Q8N394 836 aa28.02■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 GPRASP2Q96D09 838 aa28.02■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 TMEM87BQ96K49 555 aa28.02■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.02■■■□□ 2.08
CDKN3-211ENST00000611205 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28.01■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 UBE2SQ16763 222 aa28.01■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 FAM26DQ5JW98 314 aa28.01■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 CALM1P0DP23 149 aa28■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 CALM3P0DP25 149 aa28■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 KCNA2P16389 499 aa28■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 PPFIA1Q13136 1202 aa28■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 TMEM192Q8IY95 271 aa28■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 CCDC82Q8N4S0 544 aa28■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 COL4A6Q14031 1691 aa28■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa27.99■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.99■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 H3BNC9 293 aa27.99■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 CHRNA1P02708 482 aa27.99■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 ITGB5P18084 799 aa27.99■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 LEXMQ3ZCV2 418 aa27.99■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.99■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.98■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 SLC27A2O14975 620 aa27.98■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 TIGD5Q53EQ6 642 aa27.98■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 TAF2Q6P1X5 1199 aa27.98■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 BANK1Q8NDB2 785 aa27.97■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 IL9P15248 144 aa27.96■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 TMEM31Q5JXX7 168 aa27.96■■■□□ 2.07
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CDKN3-211ENST00000611205 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.96■■■□□ 2.07
CDKN3-211ENST00000611205 CTNNB1P35222 781 aa27.95■■■□□ 2.06
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CDKN3-211ENST00000611205 IGBP1P78318 339 aa27.95■■■□□ 2.06
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CDKN3-211ENST00000611205 TCEAL5Q5H9L2 206 aa27.94■■■□□ 2.06
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CDKN3-211ENST00000611205 FANCBQ8NB91 859 aa27.94■■■□□ 2.06
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CDKN3-211ENST00000611205 JADE2Q9NQC1 790 aa27.94■■■□□ 2.06
CDKN3-211ENST00000611205 MYO7AQ13402 2215 aa27.94■■■□□ 2.06
CDKN3-211ENST00000611205 TTC3P53804 2025 aa27.93■■■□□ 2.06
CDKN3-211ENST00000611205 H3BQ06 376 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CDKN3-211ENST00000611205 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CDKN3-211ENST00000611205 CDY2AQ9Y6F7 541 aa27.93■■■□□ 2.06
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