RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM87B	Q96K49	555 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGAP4	P98171	946 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	EPC2	Q52LR7	807 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	YME1L1	Q96TA2	773 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		15.99	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	ATP9A	O75110	1047 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CHRNA1	P02708	482 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CALM1	P0DP23	149 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CALM2	P0DP24	149 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CALM3	P0DP25	149 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SP4	Q02446	784 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	COL19A1	Q14993	1142 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SI	P14410	1827 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC69	A6NI79	296 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468		H3BNC9	293 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SLC27A2	O14975	620 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	MGAT3	Q09327	533 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	PTPRO	Q16827	1216 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SKAP1	Q86WV1	359 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00271	P0C7V0	271 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	RXRA	P19793	462 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	KCNA5	P22460	613 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	PPFIA1	Q13136	1202 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	MTMR1	Q13613	665 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	NECTIN1	Q15223	517 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM192	Q8IY95	271 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CD320	Q9NPF0	282 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	JADE2	Q9NQC1	790 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	MAFG	O15525	162 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	UPP2	O95045	317 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	GHR	P10912	638 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	PLA2G5	P39877	138 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	LPIN1	Q14693	890 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	GRIK4	Q16099	956 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2S	Q16763	222 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	FANCB	Q8NB91	859 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	NEK9	Q8TD19	979 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	IL17RA	Q96F46	866 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	MARK3	P27448	753 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	GPM6B	Q13491	265 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	RSPH3	Q86UC2	560 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	BANK1	Q8NDB2	785 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		15.94	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	GPR37L1	O60883	481 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	MICU3	Q86XE3	530 aa		15.93	■□□□□ 0.14
MUC1-222	ENST00000610468	GLG1	Q92896	1179 aa		15.93	■□□□□ 0.14

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