RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591417.5

HKR1-222, Transcript of HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, human

TSL 4 BASIC

Gene HKR1, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HKR1-222	ENST00000591417	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.16	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	NHLH1	Q02575	133 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	GRM4	Q14833	912 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.15	□□□□□ -0.3
HKR1-222	ENST00000591417	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	ENPP3	O14638	875 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	MBTPS2	O43462	519 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CHRNA1	P02708	482 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	GHR	P10912	638 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	IRS1	P35568	1242 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	LTBR	P36941	435 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	ADAM17	P78536	824 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	STXBP3	O00186	592 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	GRM6	O15303	877 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	SP4	Q02446	784 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	HYAL1	Q12794	435 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	WTAP	Q15007	396 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CLUL1	Q15846	466 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	PKN1	Q16512	942 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	P2RX5	Q93086	422 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.13	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417		M0QZ92	97 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	MMP1	P03956	469 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	NDUFV1	P49821	464 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	ADAM15	Q13444	863 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	IER5	Q5VY09	327 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	EDA	Q92838	391 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	GLG1	Q92896	1179 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	PRRX2	Q99811	253 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	TTC3	P53804	2025 aa		13.12	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CYTH3	O43739	400 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	DGKI	O75912	1065 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	NUCB1	Q02818	461 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	LPIN1	Q14693	890 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	GRIK4	Q16099	956 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.11	□□□□□ -0.31
HKR1-222	ENST00000591417	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.1	□□□□□ -0.31

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