RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 TTLL1O95922 423 aa7.71□□□□□ -1.18
LAMA3-211ENST00000590104 SKIP12755 728 aa7.71□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 CNGA1P29973 690 aa7.71□□□□□ -1.18
LAMA3-211ENST00000590104 TDO2P48775 406 aa7.71□□□□□ -1.18
LAMA3-211ENST00000590104 TCF15Q12870 199 aa7.71□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.7□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 TSPY8P0CW00 308 aa7.69□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 MX1P20591 662 aa7.69□□□□□ -1.18
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.69□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.69□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
LAMA3-211ENST00000590104 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.69□□□□□ -1.18
LAMA3-211ENST00000590104 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.69□□□□□ -1.18
LAMA3-211ENST00000590104 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa7.68□□□□□ -1.18
LAMA3-211ENST00000590104 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa7.68□□□□□ -1.18
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LAMA3-211ENST00000590104 RAD21O60216 631 aa7.68□□□□□ -1.18
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