RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583695.1

CNDP2-223, Transcript of carnosine dipeptidase 2, human

TSL 4

Gene CNDP2, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNDP2-223	ENST00000583695	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CNDP2-223	ENST00000583695	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CNDP2-223	ENST00000583695	COL6A3	P12111	3177 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CNDP2-223	ENST00000583695	ELP1	O95163	1332 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	CHMP2A	O43633	222 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	GAS7	O60861	476 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SYN1	P17600	705 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	MCM7	P33993	719 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	RTP1	P59025	263 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	ACTR2	P61160	394 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	BECN1	Q14457	450 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TRIM60	Q495X7	471 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	KAT2B	Q92831	832 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TCHH	Q07283	1943 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	LAMA3	Q16787	3333 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	EVPL	Q92817	2033 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	GRIN2D	O15399	1336 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	STX6	O43752	255 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	NEMF	O60524	1076 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	CABYR	O75952	493 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	F2	P00734	622 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	PSEN2	P49810	448 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	ZNF174	Q15697	407 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	CALCRL	Q16602	461 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SI	P14410	1827 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SCN5A	Q14524	2016 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	KPNA6	O60684	536 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	PPFIA4	O75335	1185 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	PSMD10	O75832	226 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	KRT76	Q01546	638 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	REST	Q13127	1097 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	ITGA7	Q13683	1181 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	MFSD10	Q14728	455 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SNX17	Q15036	470 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695		Q7L0L9	218 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	HAS1	Q92839	578 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	PCYT2	Q99447	389 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	RIT2	Q99578	217 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	EMSY	Q7Z589	1322 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	ARVCF	O00192	962 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	MARCH6	O60337	910 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	MARK3	P27448	753 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TRAPPC10	P48553	1259 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	PKP1	Q13835	747 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	DEFB123	Q8N688	67 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	VAV3	Q9UKW4	847 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SAMM50	Q9Y512	469 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695		A0A1W2PPC1	479 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695		H3BRB1	525 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	HAS3	O00219	553 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	BACH1	O14867	736 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TBX3	O15119	743 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	LGR5	O75473	907 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TLE2	Q04725	743 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	BRAP	Q7Z569	592 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	GLG1	Q92896	1179 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	FAM20A	Q96MK3	541 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	12.91	□□□□□ -0.34
CNDP2-223	ENST00000583695	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34

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