RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 APBB2Q92870 758 aa25.38■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 GPRASP2Q96D09 838 aa25.38■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 SAMD11Q96NU1 681 aa25.38■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 YME1L1Q96TA2 773 aa25.38■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 ITGB5P18084 799 aa25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 RXRAP19793 462 aa25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 MCM5P33992 734 aa25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 RPAINQ86UA6 219 aa25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 TMEM87BQ96K49 555 aa25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 UPP2O95045 317 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 CHRNA1P02708 482 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 LIFRP42702 1097 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 LEXMQ3ZCV2 418 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 TMTC2Q8N394 836 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 CD320Q9NPF0 282 aa25.36■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 CCDC69A6NI79 296 aa25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 H3BNC9 293 aa25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 MGAT3Q09327 533 aa25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 CDHR1Q96JP9 859 aa25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.35■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 SLC27A2O14975 620 aa25.34■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 KCNA5P22460 613 aa25.34■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 PTPROQ16827 1216 aa25.34■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.34■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 TMEM192Q8IY95 271 aa25.34■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.34■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 CALM1P0DP23 149 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 CALM2P0DP24 149 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 CALM3P0DP25 149 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 PPFIA1Q13136 1202 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 GPM6BQ13491 265 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 UBE2SQ16763 222 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 TIGD5Q53EQ6 642 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 LRFN3Q9BTN0 628 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 BRWD1Q9NSI6 2320 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.33■■□□□ 1.65
E2F4-210ENST00000568485 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 GHRP10912 638 aa25.32■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 MTMR1Q13613 665 aa25.32■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 GRIK4Q16099 956 aa25.32■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.32■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 C11orf16Q9NQ32 467 aa25.32■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 LINC00271P0C7V0 271 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 MARK3P27448 753 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 PLA2G5P39877 138 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 LPIN1Q14693 890 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 NECTIN1Q15223 517 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 BANK1Q8NDB2 785 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 NEK9Q8TD19 979 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 JADE2Q9NQC1 790 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.31■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.3■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 IL9P15248 144 aa25.3■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 COL19A1Q14993 1142 aa25.3■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.3■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 FANCBQ8NB91 859 aa25.3■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 IL17RAQ96F46 866 aa25.3■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.3■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.3■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 TCEAL5Q5H9L2 206 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 GLG1Q92896 1179 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 PCYT2Q99447 389 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.29■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.28■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.28■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 MAFGO15525 162 aa25.28■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.28■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 RSPH3Q86UC2 560 aa25.28■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 MICU3Q86XE3 530 aa25.28■■□□□ 1.64
E2F4-210ENST00000568485 FIBCD1Q8N539 461 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms