RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 ARNTP27540 789 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PRKAR2BP31323 418 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CCT4P50991 539 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CDK5R2Q13319 367 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CBX8Q9HC52 389 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 GJD2Q9UKL4 321 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PHIPQ8WWQ0 1821 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ATRXP46100 2492 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 SNAP23O00161 211 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ERC2O15083 957 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PEX10O60683 326 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 NME2P22392 152 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 GSTT1P30711 240 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 MMP14P50281 582 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PPATQ06203 517 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 KCTD2Q14681 263 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 AAK1Q2M2I8 961 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM60Q495X7 471 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 KRT40Q6A162 431 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PRSS33Q8NF86 280 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 FLCNQ8NFG4 579 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 FBF1Q8TES7 1133 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 MYH3P11055 1940 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PLXNA3P51805 1871 aa5.81□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 RFXAPO00287 272 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 FAM87AP0C7U9 286 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 KCNA1Q09470 495 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 TNFAIP1Q13829 316 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CCL14Q16627 93 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ASB16Q96NS5 453 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CD209Q9NNX6 404 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 RNF114Q9Y508 228 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 COL4A6Q14031 1691 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ATP2B2Q01814 1243 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CEP44Q9C0F1 390 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GUL6 1792 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ENC1O14682 589 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 FBXO24O75426 580 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 NEFMP07197 916 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 BMP6P22004 513 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 TXKP42681 527 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 TNNI2P48788 182 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ERVK-24P63145 666 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ANO1Q5XXA6 986 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 RNF214Q8ND24 703 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 ISL2Q96A47 359 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 FERMT2Q96AC1 680 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 KCNH6Q9H252 994 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 SAMM50Q9Y512 469 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.48
TMOD3-210ENST00000561408 GIPC1O14908 333 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-210ENST00000561408 PAGE1O75459 146 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-210ENST00000561408 LEFTY1O75610 366 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms