RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	DDIT3	P35638	169 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	KRT2	P35908	639 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	PTGIR	P43119	386 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	TRAPPC10	P48553	1259 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	IRF5	Q13568	498 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ZBTB33	Q86T24	672 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	DNER	Q8NFT8	737 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	SMCO2	A6NFE2	343 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	JAK2	O60674	1132 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	AP1G2	O75843	785 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	STAM2	O75886	525 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	BMP15	O95972	392 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	POLR2M	P0CAP2	368 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	HSD17B4	P51659	736 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	USP11	P51784	963 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ADCY7	P51828	1080 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	NLRP5	P59047	1200 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	KRT40	Q6A162	431 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	C17orf99	Q6UX52	265 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	BLID	Q8IZY5	108 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	BANK1	Q8NDB2	785 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	DDX11	Q96FC9	970 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CEP350	Q5VT06	3117 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965		M0R2N6	131 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	PIK3R2	O00459	728 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	LAD1	O00515	517 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	MEIS2	O14770	477 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CNMD	O75829	334 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	BRD1	O95696	1058 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CYP2C8	P10632	490 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	FCER1A	P12319	257 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ALAS1	P13196	640 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	RFC5	P40937	340 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	PRMT2	P55345	433 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CRHR2	Q13324	411 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	KCTD2	Q14681	263 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	KIF22	Q14807	665 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	NR6A1	Q15406	480 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	USH1G	Q495M9	461 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC174	Q6PII3	467 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CPXCR1	Q8N123	301 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF592	Q92610	1267 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	IWS1	Q96ST2	819 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	CPVL	Q9H3G5	476 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CHP1-208	ENST00000560965	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36

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